食品科学与工程专业毕业生的就业去向基本在“大食品行业”范围内，主要去向包括到大专院校、科研院所、食品企业及相关行业从事科学研究、技术开发、品质控制、经营管理和市场营销等工作；报考公务员到国家机关、海关、商检、食品安全管理等政府和事业单位从事行政监管工作。
食品科学与工程等食品类专业毕业生如果选择进入食品企业工作，一般有5大类就业岗位供毕业生选择，具体包括食品加工类岗位、食品检验类岗位、食品质量管理类岗位、食品销售类岗位和食品研发类岗位。
食品加工类岗位包括肉品加工、饮料加工、速冻食品加工、乳制品加工、焙烤食品制作、食品加工和调味品生产等工作岗位。这些岗位要求毕业生能熟练、准确、快速进行单元操作，对食品的配方和新技术能够实际应用；能操作与维护常见的食品加工设备。
食品检验类岗位包括食品营养成分检测、食品添加剂检测、食品中有害成分检测、食品中微生物检验等。这些岗位要求毕业生能够严格按照检验流程，对食品原辅料、半成品和成品进行取样、处理和检测；会常规检验用药品、试剂和样品的保管，检验用溶液、指示剂和培养基的配制；能使用和维护常用的分析仪器设备；能正确处理食品分析与检测的数据，会写出规范的检验报告。
食品质量管理类岗位包括食品安全生产管理、食品营养与卫生等。这些岗位需要毕业生会进行食品企业QS、ISO9000、ISO22000等认证的申请和管理；熟知生产车间的规范操作和卫生管理。
食品销售类岗位包括食品市场开发与维护、食品销售与服务等。这些岗位需要毕业生会做调查市场、分析市场；进行产品宣传和推销方案的制定。
食品研发类岗位包括新产品开发、新技术应用等。这些岗位要求毕业生了解食品科技最新动向，具备市场分析、预测能力；按照食品质量安全法律法规和营养知识开发新产品。