encoder decoder 模型是比较难理解的，理解这个模型需要清楚lstm 的整个源码细节，坦率的说这个模型我看了近十天，不敢说完全明白。

• 我把细胞的有丝分裂的图片放在开头，我的直觉细胞的有丝分裂和这个模型有相通之处

定义训练编码器

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# 定义训练编码器
#None表示可以处理任意长度的序列
# num_encoder_tokens表示特征的数目,三维张量的列数

encoder_inputs = Input(shape=(None, num_encoder_tokens),name='encoder_inputs')  

# 编码器，要求其返回状态，lstm 公式理解https://blog.csdn.net/qq_38210185/article/details/79376053  
encoder = LSTM(latent_dim, return_state=True,name='encoder_LSTM')               # 编码器的特征维的大小latent_dim,即单元数,也可以理解为lstm的层数

#lstm 的输出状态，隐藏状态，候选状态
encoder_outputs, state_h, state_c = encoder(encoder_inputs) # 取出输入生成的隐藏状态和细胞状态，作为解码器的隐藏状态和细胞状态的初始化值。

#上面两行那种写法很奇怪，看了几天没看懂，可以直接这样写
#encoder_outputs, state_h, state_c= LSTM(latent_dim, return_state=True,name='encoder_LSTM')(encoder_inputs)

# 我们丢弃' encoder_output '，只保留隐藏状态，候选状态
encoder_states = [state_h, state_c]  
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定义训练解码器

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# 定义解码器的输入
# 同样的，None表示可以处理任意长度的序列
# 设置解码器，使用' encoder_states '作为初始状态
# num_decoder_tokens表示解码层嵌入长度,三维张量的列数
decoder_inputs = Input(shape=(None, num_decoder_tokens),name='decoder_inputs')  

# 接下来建立解码器，解码器将返回整个输出序列
# 并且返回其中间状态，中间状态在训练阶段不会用到，但是在推理阶段将是有用的
# 因解码器用编码器的隐藏状态和细胞状态，所以latent_dim必等
decoder_lstm = LSTM(latent_dim, return_sequences=True, return_state=True,name='decoder_LSTM')   
# 将编码器输出的状态作为初始解码器的初始状态
decoder_outputs, _, _ = decoder_lstm(decoder_inputs,
                                     initial_state=encoder_states)

# 添加全连接层
# 这个full层在后面推断中会被共享！！
decoder_dense = Dense(num_decoder_tokens, activation='softmax',name='softmax')  
decoder_outputs = decoder_dense(decoder_outputs)
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定义训练模型

# Define the model that will turn
# `encoder_input_data` & `decoder_input_data` into `decoder_target_data`
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model = Model([encoder_inputs, decoder_inputs], decoder_outputs)    #原始模型  
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#model.load_weights('s2s.h5')
# Run training
model.compile(optimizer='rmsprop', loss='categorical_crossentropy')
model.fit([encoder_input_data, decoder_input_data], decoder_target_data,
          batch_size=batch_size,
          epochs=epochs,
          validation_split=0.2)
# 保存模型
model.save('s2s.h5')

显示模型的拓扑图

import netron
netron.start("s2s.h5")

# 定义推断编码器  根据输入序列得到隐藏状态和细胞状态的路径图，得到模型，使用的输入到输出之间所有层的权重，与tf的预测签名一样
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encoder_model = Model(encoder_inputs, encoder_states)                #编码模型 ，注意输出是  encoder_states = [state_h, state_c]  
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encoder_model.save('encoder_model.h5')

import netron
netron.start('encoder_model.h5')

#解码的隐藏层
decoder_state_input_h = Input(shape=(latent_dim,))
#解码的候选门
decoder_state_input_c = Input(shape=(latent_dim,))
#解码的输入状态
decoder_states_inputs = [decoder_state_input_h, decoder_state_input_c]


decoder_outputsd, state_hd, state_cd = decoder_lstm(decoder_inputs, initial_state=decoder_states_inputs)

decoder_statesd = [state_hd, state_cd]
decoder_outputsd1 = decoder_dense(decoder_outputsd)
decoder_model = Model(
    [decoder_inputs] + decoder_states_inputs,
    [decoder_outputsd] + decoder_statesd)

    # 将输入编码为状态向量
    #注意输出是  encoder_states = [state_h, state_c]  
    # states_value  是一个有两元素的列表，每个元素的维度是256
    states_value = encoder_model.predict(input_seq)             
    # 生成长度为1的空目标序列
    target_seq = np.zeros((1, 1, num_decoder_tokens))
    # 用起始字符填充目标序列的第一个字符。

    target_seq[0, 0, target_token_index['\t']] = 1.
    # 对一批序列的抽样循环(为了简化，这里我们假设批大小为1)
    stop_condition = False
    decoded_sentence = ''
    while not stop_condition:
        output_tokens, h, c = decoder_model.predict(
            [target_seq] + states_value)
        # Sample a token
        sampled_token_index = np.argmax(output_tokens[0, -1, :])
        sampled_char = reverse_target_char_index[sampled_token_index]
        decoded_sentence += sampled_char
        # 退出条件:到达最大长度或找到停止字符。
        if (sampled_char == '\n' or len(decoded_sentence) > max_decoder_seq_length):
            stop_condition = True
        # 更新目标序列(长度1)
        target_seq = np.zeros((1, 1, num_decoder_tokens))
        target_seq[0, 0, sampled_token_index] = 1.
        
        print(sampled_token_index)
        # 更新状态
        states_value = [h, c]